最近，國務(wù)院辦公廳印發(fā)《關(guān)于促進(jìn)社會(huì)辦醫(yī)加快發(fā)展若干政策措施的通知》（國辦發(fā)〔2015〕45號(hào)），要求落實(shí)醫(yī)療機(jī)構(gòu)稅收政策，鼓勵(lì)和引導(dǎo)社會(huì)資本舉辦醫(yī)療機(jī)構(gòu)。目前，我國公立醫(yī)療機(jī)構(gòu)都是非營利性，非公立醫(yī)療機(jī)構(gòu)即社會(huì)資本所辦醫(yī)療機(jī)構(gòu)包括營利性和非營利性兩類，相應(yīng)的稅收政策適用也應(yīng)有所區(qū)分。

共性

●營業(yè)稅

營業(yè)稅暫行條例第八條第（三）款規(guī)定，醫(yī)院、診所和其他醫(yī)療機(jī)構(gòu)提供的醫(yī)療服務(wù)免征營業(yè)稅。

提示：1.自2009年1月1日起，醫(yī)療機(jī)構(gòu)（包括營利性、非營利性的公立、民營、個(gè)體以及部隊(duì)醫(yī)療機(jī)構(gòu)）不再區(qū)分營利性和非營利性醫(yī)療機(jī)構(gòu)，對(duì)其取得的醫(yī)療服務(wù)收入均免征營業(yè)稅，不受價(jià)格期限的限制。

2.對(duì)非營利性醫(yī)療機(jī)構(gòu)從事非醫(yī)療服務(wù)取得的收入，如租賃收入、財(cái)產(chǎn)轉(zhuǎn)讓收入、培訓(xùn)收入、對(duì)外投資收入等應(yīng)按規(guī)定征收各項(xiàng)稅收。

●個(gè)人所得稅

《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于醫(yī)療機(jī)構(gòu)有關(guān)個(gè)人所得稅政策問題的通知》（財(cái)稅〔2003〕109號(hào)）規(guī)定，《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)有關(guān)稅收政策的通知》（財(cái)稅〔2000〕42號(hào)）規(guī)定的對(duì)非營利的醫(yī)療機(jī)構(gòu)按照國家規(guī)定的價(jià)格取得的醫(yī)療服務(wù)收入免征各項(xiàng)稅收，僅指機(jī)構(gòu)自身的各項(xiàng)稅收，不包括個(gè)人從醫(yī)療機(jī)構(gòu)取得所得應(yīng)納的個(gè)人所得稅。按照個(gè)人所得稅法的規(guī)定，個(gè)人取得應(yīng)稅所得，應(yīng)依法繳納個(gè)人所得稅。個(gè)人因在醫(yī)療機(jī)構(gòu)（包括營利性醫(yī)療機(jī)構(gòu)和非營利性醫(yī)療機(jī)構(gòu)）任職而取得的所得，依據(jù)個(gè)人所得稅法的規(guī)定，應(yīng)按照“工資、薪金所得”應(yīng)稅項(xiàng)目計(jì)征個(gè)人所得稅。

●稅務(wù)登記

無論營利性與非營利性醫(yī)療機(jī)構(gòu)均應(yīng)依法辦理稅務(wù)登記。國辦發(fā)〔2015〕45號(hào)文件規(guī)定，社會(huì)資本可按照經(jīng)營目的，自主申辦營利性或非營利性醫(yī)療機(jī)構(gòu)。衛(wèi)生、民政、工商、稅務(wù)等相關(guān)部門要依法登記，分類管理。

稅收征管法實(shí)施細(xì)則第十二條規(guī)定，從事生產(chǎn)、經(jīng)營的納稅人應(yīng)當(dāng)自領(lǐng)取營業(yè)執(zhí)照之日起30日內(nèi)，向生產(chǎn)、經(jīng)營地或者納稅義務(wù)發(fā)生地的主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)辦理稅務(wù)登記，如實(shí)填寫稅務(wù)登記表，并按照稅務(wù)機(jī)關(guān)的要求提供有關(guān)證件、資料。前款規(guī)定以外的納稅人，除國家機(jī)關(guān)和個(gè)人外，應(yīng)當(dāng)自納稅義務(wù)發(fā)生之日起30日內(nèi)，持有關(guān)證件向所在地的主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)辦理稅務(wù)登記。

發(fā)票管理辦法第十五條規(guī)定，需要領(lǐng)購發(fā)票的單位和個(gè)人，應(yīng)當(dāng)持稅務(wù)登記證件、經(jīng)辦人身份證明、按照國務(wù)院稅務(wù)主管部門規(guī)定式樣制作的發(fā)票專用章的印模，向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理發(fā)票領(lǐng)購手續(xù)。

稅收征管法實(shí)施細(xì)則第十八條規(guī)定，除按照規(guī)定不需要發(fā)給稅務(wù)登記證件的外，納稅人辦理包括申請(qǐng)減稅、免稅、退稅和領(lǐng)購發(fā)票等事項(xiàng)時(shí)，必須持稅務(wù)登記證件。

稅務(wù)登記管理辦法第九條規(guī)定，納稅人辦理開立銀行賬戶和領(lǐng)購發(fā)票事項(xiàng)時(shí)，必須提供稅務(wù)登記證件，納稅人辦理其他稅務(wù)事項(xiàng)時(shí)，應(yīng)當(dāng)出示稅務(wù)登記證件，經(jīng)稅務(wù)機(jī)關(guān)核準(zhǔn)相關(guān)信息后辦理手續(xù)。

差異

●優(yōu)惠規(guī)定

1.非營利性醫(yī)療機(jī)構(gòu)

增值稅：對(duì)非營利性醫(yī)療機(jī)構(gòu)自產(chǎn)自用的制劑，免征增值稅；非營利性醫(yī)療機(jī)構(gòu)的藥房分離為獨(dú)立的藥品零售企業(yè)，應(yīng)按規(guī)定征收各項(xiàng)稅收。

房產(chǎn)稅、土地使用稅、車船使用稅：對(duì)符合規(guī)定的社會(huì)辦非營利性醫(yī)療機(jī)構(gòu)自用的房產(chǎn)、土地、車船，免征房產(chǎn)稅、城鎮(zhèn)土地使用稅和車船使用稅。

企業(yè)所得稅：社會(huì)辦醫(yī)療機(jī)構(gòu)按照企業(yè)所得稅法規(guī)定，經(jīng)認(rèn)定為非營利組織的，對(duì)其提供的醫(yī)療服務(wù)等符合條件的收入免征企業(yè)所得稅；企業(yè)、個(gè)人通過公益性社會(huì)團(tuán)體或者縣級(jí)以上人民政府及其部門對(duì)社會(huì)辦非營利性醫(yī)療機(jī)構(gòu)的捐贈(zèng)，按照稅法規(guī)定予以稅前扣除。